古静海寺始建于明永乐年间。据明葛寅亮《金陵梵志》记载：“卢龙山静海寺，在都城外，南去仪凤门半里，所统天界寺二十里，西城卢龙山之麓。文王命使海外，平服诸番，风波无警，因建寺，赐额静海。”据明俞彦所撰《静海寺重修疏序》记载：“文皇帝践祚，海夷西洋，尚逆颜行，爰命专征，艨艟千计，战士帅属以万万计，乃折鲸鲵飓涛弱浪之外，楼帆无恙，获所贡琛异以归，岁奉朝朔，皇灵震荡。说者奇其绩，谓为神天护呵，合建成寺酬报。诏可，赐今额，遂为名刹焉。”据康熙《江宁府志》记载：“静海寺在仪凤门外卢龙山之麓。明永乐年间，命使海外，风波无警，因建成寺，赐额静海。”

　　古静海寺规模宏阔，占地三十亩。据《金陵梵刹志》载，寺庙有殿堂金刚殿三楹，左钟楼一座，右井亭一座，天王殿三楹，正佛殿三楹，左观音殿三楹，左伽蓝殿二楹，右托藏殿三右弥勒殿三楹，可祖师殿二楹，潮音阁五楹，左华严楼三楹回廊二十楹。玩咸亭一座。方丈一所十六楹。公学三楹。僧院四十房。正门一座，华严楼三楹，禅堂左右两堂共六楹，十方堂三楹。茶厨房、旧禅堂一所。此外，公产田地塘二百余亩。清甘熙在《白下琐言》记有：“仪凤门外静海寺，明永乐建，规模宏阔，础石大若车轮，润如苍玉，柱皆数围，或云沉香木为之，其实钟山南木耳。”

　　静海寺在历史上曾几毁几修。明正德年间重修静海寺，据《静海寺重记略》载：“狮子山之阳，有静海寺焉，鼎创岁深，蛊坏日甚。用浮图故事，费出募缘经营三载，厥功告孱，凡为殿四，堂六，亭亦四。若门，若阁，若楼，若方丈室各一，若画廊以间计则四十……”“据《郑和下西洋资料汇编（下）》编者按载“南京静海寺，自永乐初创筑后，至正德、万历、干隆间三经重修，于道光十二年被火焚毁。嗣后再经重建，道光二十二年第一次鸦片战争失败后，即在此寺签订中英南京条约。在太平天国战争中，静海寺再度被毁，事后又由静安和尚再行募修。……一九三七年冬，日军进攻南京，此寺于是年十二月十日大半被毁。据寺僧讲，计焚去头门韦驮殿三间，二门天王殿五间，毗卢殿三间，地藏殿三间，观音殿三间，大客堂三间，老大殿地基平房三间，影堂三间，祖堂三间，斋堂三间，库房四间，云水堂三间，大厨房五间，楼房五间，共四十九间。仅存方丈室六间，念佛堂五间，其临街（绥远路）大门‘静海律寺’四字，亦尚存在。”

　　解放后，静海寺曾一度作校舍用。1982年，南京开展大规模文物普查工作，静海寺遗址被发现。当时仅剩残缺的东配殿２楹6间，其中3间是100多年前的建筑，3间是200多年前的建筑。除挂边一间被街道工厂占用，其余由下关区土杂公司租为仓库。

1983年开始，下关区文化局的领导为修复静海寺偏殿而积极筹备。1985年静海寺被定为市级文物保护单位。1988年投入资金48万元对静海寺遗址进行拆除复建。复建后的静海寺，为仿明庙宇建筑，但非原建筑的复原，占地628平方米。