宝志塔始建于梁天监年间，是为南北朝名僧宝志公所建。原在钟山西南麓独龙阜(现明孝陵)，现位于南京东郊灵谷寺无梁殿西侧。

　　据《金陵梵刹志》载：“师讳宝志，金陵人，宋文帝元嘉十三年(436年)丙子示迹东阳市古木鹰巢中，民人朱氏妇巳汲水闻儿啼，归报其家，梯树得之，举以为子，就指为姓。七岁去依钟山大沙门法俭为童子，俭名之曰宝志。”《南史?陶弘景传》后附有沙门宝志事：宋泰始中见之，出入钟山，往来都邑。宋、齐之交，稍显灵迹，好为谶记。其谶记流传后世者，大多散见于《南史》各传中。如《梁武纪》：天监中宝志有诗云：“昔年三十八，今年八十三，四中复有四，城北火酣酣。”武帝命人记下。梁武帝于502年攻人建康，建立梁朝，此时他83岁。83岁时，梁武帝“舍身”当和尚的同泰寺发生火灾，火起之日恰为四月十四日，宝志的话得到了应验。有关他的传说，在民间流传甚广。唐代大诗人李白作有《宝公赞》一首：“水中之月，了不可取，虚空其心，寥廓无主。锦檬鸟爪，独行绝侣，刀齐尺梁，扇述陈语，丹青圣容，何住何所。”

　　梁武帝对宝志敬奉有加，呼为志公。梁天监十二年(513年)宝志圆寂，武帝将宝志葬于钟山独龙阜。十三年(514年)，梁武帝的女儿永定公主出资为宝志建塔于墓地之上，塔顶镶有琉璃珠宝，阳光下五光十色。后又在塔前建寺曰开善寺。唐干符(875?D879年)中改宝公院。宋开宝中改开善道场，太平兴国五年(980年)曰太平兴国寺，庆历三年改十方禅院。绍兴三十一年(1161年)，金人犯淮甸，据说宝志曾显灵相助，使虏酋就殄。宋高宗遂下旨加封宝志“慈应”的称号，又建塔曰“感应”。

明初为蒋山寺。洪武十四年(1381年)为了营造孝陵，朱元璋下令把蒋山寺、宝志公塔、宝志公殿及三绝碑等一同迁至今地。现塔前的宝志公殿为1982年复建，殿三楹，内供奉宝志大师雕像。原殿内有元代大书法家赵孟颡“宝公菩萨十二歌”碑，现已无存。殿后有宝公塔和三绝碑。原塔毁于清咸丰年间，现存的塔为同治年间曾国荃重修。三绝碑为梁代大画家张僧繇专为开善寺绘制的一幅宝志公像，到了唐代，大画家吴道子根据张僧繇画的志公像，又重新绘制，诗人李白作像赞，书法家颜真卿写字，并将其同刻于一块石碑之上，故称“三绝碑”。今日的三绝碑为按旧臧本重刻。