陕西法门寺中的佛指舍利共有四枚，三枚影骨、一枚灵骨。四枚佛指舍利，除第三枚灵骨微黄，质地似骨以外，其余一、二、四号三枚，质地均类似白玉，按地宫《志文碑》称之为“影骨”。

灵骨指佛陀真身舍利；中国佛教历经三武一宗法难，古代高僧大德乃仿佛陀真身灵骨精造三枚‘影骨舍利’此为古人保护真身灵骨的良苦用心。影骨即灵骨之影应、应现，以证示灵骨之不灭。佛教界认为，影骨与灵骨是不异的关系，赵朴初先生赞颂说：“影骨非一亦非异，了如一月映三江。”

　　根据发现的时间顺序，文物考古与宗教界人士将地宫内发现的4枚佛指舍利依次排列后命名为第一枚佛指舍利，第二枚佛、第三枚和第四枚佛指舍利。

　　其中前室为阿育王塔第四枚舍利，中室为汉白玉灵帐第二枚舍利，后室为八重宝函第一枚舍利，密室的是五重宝函第三枚舍利。

　　真身佛指舍利（灵骨）亦称“第三枚佛指舍利”，发现于1987年5月10日。因担心在遭遇法难时被毁，此枚舍利被秘藏在地宫后室正面墙根下的泥土中。舍利为五重宝函所包裹。第一重宝函为铁质，出土时已锈迹斑斑，呈深褐色。第二重宝函是一个精美的银质鎏金函，函身雕凿有45尊造像，所以被命名为“四十五尊造像顶函”。函身东侧下方錾刻有“奉皇帝敕造释迦牟尼真身宝函”。第三重宝函是一檀香木函。木质已朽，其顶及函身都有银质雕花包角。第四重宝函是一副水晶椁。椁顶嵌有黄、蓝宝石各一颗。在椁盖上雕着观音菩萨坐像。第五重宝函是一个壶门座玉棺。玉棺放在雕花棺床之上。玉棺之内供奉的舍利就是释迦牟尼佛真身灵骨（为左手中指）。指节其色微黄，有裂纹和斑点。

　　第一枚佛指舍利（影骨）发现于1987年5月5日凌晨一时。位于地宫后室的它是所有四枚舍利中受到最隆重礼遇的一枚，一共被八重宝函所包裹。依次为（从外向内数）：第一重宝函是银棱顶黑漆檀香木宝函。第二重宝函是鎏金四天王顶银宝函。第三重宝函是素面顶银函，函顶和四面雕刻有佛像。第四重宝函是鎏金如来说法顶银函。第五重宝函是如意轮观音顶金函。第六重宝函是金筐宝钿珍珠装金函。第七重宝函是金筐宝细珍珠装珷玞石函。第八重宝函是宝珠顶单檐四门金塔。在金塔塔基上立一银柱，佛指舍利便套在银柱之上。这枚指舍利是四枚舍利中外表最美好的一枚。

佛指舍利（影骨） 鎏金双凤纹银棺

　　第二枚佛指舍利（影骨）发现于1987年5月9日，位于中室。这枚舍利供奉在一座汉白玉灵帐之中。灵帐如果可称宝函的话，则是地宫中最大的宝函。它高164厘米，约与人等高。灵帐造于唐中宗景龙二年（公元708年）。汉白玉灵帐中空，内置一顶铁函是第二重宝函；铁函之内鎏金双凤银棺是第三重宝函。第二枚佛指舍利即在其中。

　　第四枚佛指舍利（影骨）于1987年5月12日在地宫前室发现，供奉在三重宝函之中。第一重宝函是汉白玉制阿育王塔，由塔座、塔身、塔顶、塔尖组成，塔身着彩。第二重宝函是塔式铜精舍，极精致、结构亦极复杂。第三重宝函是银棺，银棺上刻有佛弟子及迦陵频伽鸟，棺下为沉香木雕花棺床，第四枚佛指舍利即在其中。